1.工商方面
资料审核问题
材料不齐：如果缺少营业执照副本、法定代表人身份证、新地址证明等关键材料，工商部门将无法受理迁移变更申请。例如，只带了营业执照副本复印件而没有原件，就不符合要求。
证明材料不符合要求：新地址的租赁合同可能存在不规范的情况，如缺少租赁双方的签字盖章、租赁期限不明确等。或者房产证复印件模糊不清，无法有效证明地址的合法性。
注册地址冲突问题
新地址已被注册：当企业选定的新地址已经被其他企业注册，就不能再用于本企业的迁移登记。例如，有的企业可能在没有核实新地址情况的前提下就提交申请，结果发现新地址无法使用。
同一地址注册限制：某些地区对于同一地址的企业注册数量有严格限制，即使新地址未被完全占用，但如果已经达到该地区规定的同一地址注册企业上限，也会导致迁移受阻。
档案交接问题
档案丢失或损坏：在原工商部门和新工商部门之间交接企业档案的过程中，可能会出现档案丢失、部分文件损坏等情况。例如，由于邮寄过程中的失误，导致档案包裹丢失，影响企业迁移进度。
档案内容不符：原工商部门提供的企业档案与新工商部门接收后的档案内容存在差异，如档案中的重要文件版本不一致、登记信息有出入等，需要花费时间核实和补充。
2.税务方面
税务清算问题
未完成纳税申报：在迁移前，企业需要完成迁出地的纳税申报工作。如果存在未申报的税款，税务部门会要求企业先完成申报并缴纳相应税款后才能办理迁出手续。例如，企业遗漏了某个季度的企业所得税申报，就需要补申报。
存在税务违规行为：若企业被发现存在税务违规行为，如偷税、漏税等，税务部门会进行调查和处理。在处理完成之前，企业的跨区迁移手续将被暂停。
税务系统衔接问题
系统数据迁移困难：税务系统中企业的历史数据，如纳税记录、发票信息等，在跨区迁移时可能出现数据迁移不完整或错误的情况。例如，一些特殊的税收优惠备案信息在迁移后无法正确显示。
两地税务政策差异：不同区域的税务政策可能存在差异，企业在迁移后可能需要重新了解和适应新的税务政策。例如，迁入地对于某些行业的税收优惠条件和迁出地不同，企业需要重新评估自身是否符合新的优惠政策。
3.其他方面
银行账户问题
银行账户信息更新困难：企业迁移地址后，需要及时更新银行账户的预留信息。但有些银行可能要求企业提供较多的证明材料，如新的营业执照、税务登记证、地址证明等，且办理流程繁琐。
账户冻结风险：如果银行在对企业账户进行例行检查或发现企业信息变更后未及时更新，可能会暂时冻结账户，影响企业的资金流转。
许可证及资质证书问题